Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRRQ15256 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRRQ15256 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRRQ15256 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRRQ15256 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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