Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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