Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSHL1Q14406 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSHL1Q14406 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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