Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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SCARF1Q14162 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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SCARF1Q14162 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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