Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SPIDRQ14159 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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