Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms