Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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