Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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