Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms