Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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