Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TWF1Q12792 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TWF1Q12792 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TWF1Q12792 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TWF1Q12792 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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