Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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