Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms