Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms