Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms