Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms