Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms