Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUCB1Q02818 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms