Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms