Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms