Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms