Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms