Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms