Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG7P83436 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG7P83436 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG7P83436 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms