Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms