Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME5P56597 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME5P56597 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME5P56597 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms