Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms