Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK1P49759 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLK1P49759 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms