Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCT3P49368 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCT3P49368 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCT3P49368 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms