Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITPNBP48739 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITPNBP48739 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITPNBP48739 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms