Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms