Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGCXP38435 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGCXP38435 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms