Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms