Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7BP35670 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms