Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA1P35221 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms