Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5DP30049 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms