Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NMBRP28336 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms