Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms