Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms