Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTFRP26992 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms