Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms