Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRPH2P23942 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms