Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms