Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms