Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NF1P21359 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NF1P21359 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NF1P21359 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NF1P21359 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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