Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH2P19022 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH2P19022 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms