Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms