Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEFHP12036 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEFHP12036 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms