Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODC1P11926 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms