Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFMP07197 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms